脫硫煙氣CEMS主要用于監測脫硫工藝設備的運行效率，以及實時監測脫硫后排放煙氣的二氧化硫、氮氧化物、煙塵的濃度和排放率。通過監控排放源二氧化硫的實時排放濃度及排放總量，為環境監測及污染減排提供排放總量考核的基礎數據，為二氧化硫排放總量及是否可交易的二氧化硫排放量提供數據。

通常對煙氣脫硫設備在脫硫前及脫硫后分別進行煙氣二氧化硫的監測。

 固定排放源在脫硫前的原煙氣，其二氧化硫排放濃度及排放量受到燃燒的煤種或原料的含硫量不同，以及燃燒工況不同，原煙氣的二氧化硫排放濃度及排放量也不同。根據原煙氣二氧化硫的排放濃度及排放量，脫硫設備的運行工況及投放的脫硫原輔料也會調整，在確保排放的凈煙氣的二氧化硫排放濃度及排放量達標的前提下，要盡量降低脫硫設備的運行費用，確保脫硫設備的安全、經濟、有效運行。

 我國燃煤電廠脫硫煙氣CEMS技術經過近十余年的快速發展已經相當成熟。據有關統計我國在固定污染源已安裝的煙氣CEMS有1.8萬余套用于連續監控治理實施的運行狀況、污染物排放、監督執法、排污申報核定等提供基礎數據，有力推動和提高了環境監測和管理水平，也促進了國內形勢環境監測的煙氣CEMS產業的快速發展。