CEMS管理制度和檔案驗收主要包括兩部分內容：一是CEMS相關文件、資質、報告和相關標識的審查；二是CEMS相關運行管理、校準校驗以及設備管理等方面建立的制度和相應的記錄。

1.CEMS相關文件、資質、報告和標識

按照有關環境管理要求，CEMS現場應具備的基本文件、資質、報告和相關標識包括：

a.環境保護部環境監測儀器質量監督檢測中心適用性檢測合格報告；

b.中國環境保護產業協會認證中心環境保護產品認證證書（標識）；

c.CEMS現場安裝和調試檢測報告；

d.CEMS現場和聯網驗收檢測報告和相關批復文件；

e.CEMS日常定期比對檢測報告和數據有效性審核批復文件（標識）；

f.環境污染治理設施運營資質證書（自動在線檢測氣類）（如果有運營）。

2.CEMS運行管理、校準校驗以及設備管理等制度和記錄

①崗位責任管理制度

a.排污單位、設備供應商或制造商的運營單位的責任管理制度；

b.設備管理人員和運營維護人員的崗位責任管理制度；

c.設備檔案建立和責任管理制度；

d.設備日常運行自查制度；

f.設備更新（更換）程序和制度。

②儀器設備操作使用規范和運營維護制度

a.儀器設備使用管理制度和使用技術說明；

b.系統運行和使用操作規程或運行作業指導書；

c.系統日常巡檢制度；

d.系統定期維護保養制度；

e.系統定期校準和校驗制度；

f.系統易損、易耗品的定期檢查和更換制度；

g.系統故障維修制度；

③相關記錄和臺賬

a.日常巡檢記錄；

b.定期維護保養記錄；

c.定期校準和校驗記錄；

d.故障維修和耗材更新（更換）記錄；

e.儀器設備相關臺賬和技術檔案。