煙氣CEMS樣品排放包括分析儀的廢氣排放，以及旁通流(快速放散回路樣品流)和樣品處理過程的廢液排放。應注意滿足在線分析儀出口的廢氣對出口端的排放要求。

 樣品排放的功能要求是保持樣品的廢氣、廢液排放暢通及排放口的壓力要穩定，不受外界環境的影響。

 煙氣CEMS樣品廢氣、廢液的排放點可以是對大氣排放的點、過程管路或容器的入口端、外部排放系統的處理系統的入口端。分析系統排放的廢氣、廢液會集中到排放總管，然后排放到大氣環境中，稱為集管排放。當在線分析儀對廢氣排放點的壓力波動有要求時應采取必要的措施，保證排放點的壓力波動不影響儀器的分析結果。

 有毒、有害、易燃、易爆的廢氣排放要特別注意安全排放，必要時要進行環保及安全處理后再排放。有回收利用價值的樣品廢氣要返回到流程管道中，需要采取特別的措施，如回流取樣技術。廢液排放，如煙氣經氣溶膠過濾器去除的液滴，及冷凝除濕器等排出的廢液，要通過廢液排放總管及時排到分析小屋的外部。特別寒冷地區的廢液排放管路應采取保溫措施，防止廢液結冰堵塞排放管路。

 排放樣品回收也可使用機械方法使低壓產品返回流程。低壓產品可從旁路樣品流和(或)分析儀器出口的氣流得到。典型樣品回收是帶有泵的容器，由容器的液位開關控制泵的啟動。